法律分析:

1、醫療器械經營備案憑證與醫療器械經營許可證效期有差異：從有效期方面來說，醫療器械經營備案憑證暫時沒有規定有效期，而醫療器械經營許可證的有效期為5年。

2、醫療器械經營備案憑證與醫療器械經營許可證上載明的內容有差異：

從證書上載明的內容來說，醫療器械經營許可證載明許可證編號、企業名稱、法定代表人、企業負責人、住所、經營場所、經營方式、經營范圍、庫房地址、發證部門、發證日期和有效期限等事項；醫療器械經營備案憑證載明編號、企業名稱、法定代表人、企業負責人、住所、經營場所、經營方式、經營范圍、庫房地址、備案部門、備案日期等事項。

醫療器械經營許可證和第二類醫療器械經營備案憑證都是由食品藥品監督管理部門發放。

1、醫療器械經營許可證是從事醫療器械經營的必要法律文件，沒有此許可證，企業不能從事相關的經營活動。

2、第二類醫療器械經營備案憑證則是對企業從事第二類醫療器械經營的備案記錄，是合法經營的證明之一。

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